每日速读!株洲建成首个“二代+三代”新冠病毒全基因测序实验室


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近日,株洲市疾控中心从哨点医院收集门诊、住院患者样本进行新冠病毒全基因组测序获得成功,标志着该中心顺利建成全市首个“二代+三代”新冠病毒全基因测序实验室。

病原体的全基因组测序主要是利用二代、三代测序技术平台对病原基因组序列进行完全测定,通过对基因序列的深入分析揭示病原微生物在基因组层面的变化,解释病毒的来源、传播、变异演化等问题。目前株洲市疾控中心已具备二代高通量测序仪(圣湘生物SansureSeq1000)和三代纳米孔测序仪(Nanopore MinIONMK1C)。二代高通量测序能够同时对上百万甚至数十亿个DNA进行分析,快速实现病原体菌种鉴定、分子分型、毒力及耐药分析和传播溯源等。三代纳米孔测序便捷灵活、超长读长,可实现数据实时分析。株洲市疾控中心已基于二代、三代测序平台开展多批次新冠病毒全基因组测序,分析结果显示株洲当前疫情主要流行株为奥密克戎(Omicron)BA.5.2和BF.7两种变异株,其中BA.5.2仍然是主要流行毒株。尚未发现传播力、致病力和免疫逃逸能力具有明显变化的奥密克戎新毒株。

株洲市疾控中心将持续不断新冠变异株监测工作,实时动态监测新冠病毒变异情况,及时监测和捕获新冠病毒变异株,为今后株洲新冠疫情精准溯源、风险研判与预警、毒株变异研究等方面提供关键技术支撑。

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